肉用褐牛是新疆维吾尔自治区畜牧科学院自1993年起以乳肉兼用牛的新疆褐牛为基础，为改善其尖尻、斜尻、肌肉附着能力差等问题，选育出的在生长发育、肉质和抗逆性等指标方面兼顾的肉牛新类型。肉用褐牛日增重1.35kg以上，不仅屠宰率可达62%，而且肌内脂肪可达6.9%-7.5%，由于其风味独特远销海南、广东等省区。

为助力新疆肉用褐牛产业发展，自治区畜牧科学院畜牧研究所褐牛创新团队针对该品种注册登记工作中常会因系谱记录不清而导致核心群种牛遗传评估参考群体准确性不高等问题，开发了一款SNP基因型检测的“5K液相芯片”，可用于低成本、大规模的组建肉用型新疆褐牛基因组数据库，通过开展DNA亲子鉴定和系谱校准工作，完善核心群遴选和管理标准。

该芯片的技术开发主要是通过对种公牛进行全基因组20X重测序以及核心群母牛进行高密度芯片检测，在1000余份基因型的数据基础上，按照测序深度>20，MAF＞0.3，检出率＞99%，上下游200bp序列中同源片段数量＜5个，GC含量在30-70%之间，且均匀分布在常染色体上的标准挑选了3500个位点。加上国际基因组协会和ICAR组织的公用亲子鉴定位点554个位点，以及通过全基因组关联分析鉴定到的与生长、屠宰性能相关的951个位点，利用靶向测序基因分型检测技术GenoBaits液相探针的方式，研发形成了“肉用褐牛（5K）芯片”基因型检测产品。目前该芯片已在伊犁州尼勒克县、昭苏县牛场投入使用。

该芯片的研制成功并投入使用，实现了肉牛育种芯片的实用化，对于促进新疆肉用褐牛产业发展具有重要意义。