畜牧业的发展水平是一个国家或一个地区农业发达程度的重要标志。加快现代畜牧业的发展，是我国加入世贸组织和农村经济进入新的发展阶段后，调整农业结构、增加农民收入、维护农村稳定的必然选择，更是新疆维吾尔自治区全面建设小康社会的重要举措。
    当前，新疆维吾尔自治区畜牧业增长势头强劲，畜产品产量增长，价格合理回升，发展畜牧业已经成为农牧民增收的重要来源。2007年全区牲畜存栏总数为5284万头（只），比2006年的5510万头（只）略有下降，这是自治区首度出现的牲畜年末存栏数略有下降的局面。但2007年全区畜牧业总产值却达到227亿元，较上年增长8%，牲畜出栏数较上年增长16.1%。农牧民人均增收来自畜牧业的达244元，占到农牧民人均增收的56.74%。
    新疆畜牧业发展也存在一些亟待解决的问题：一是畜牧业发展的整体水平不高，生产方式落后，产业结构不合理。二是投入不足，畜禽良种繁育等基础设施总体薄弱。近两年，奶牛等主要畜禽良种不能满足畜牧业快速发展的需要，对进口良种的依赖程度较高。三是农副产品转化利用率低，不成规模的饲养方式使得饲养成本居高不下，消费严重受阻。四是主要畜产品产量偏低，安全问题仍然存在。五是畜产品流通的“绿色通道”还没有完全建立。六是对养殖业概念模糊，加之只重视林果、棉花、石油、红色产业，缺乏对养殖业生产的正确引导和政策支持。七是动物疫病防治问题仍然存在，在一定程度上影响了畜牧业持续健康发展。
    为尽快把畜牧业发展成为一个大产业，转化粮食和其他副产品，带动种植业和相关产业发展，实现农产品多次增值，吸纳农业富余劳动力，增加农民就业机会，实现真正意义上的传统畜牧业大突破、现代畜牧业大发展，使畜牧业真正成为推动农业、农村经济发展和农民增收致富的支柱产业，应进一步采取以下对策措施：
    加大扶持力度，充分发挥畜牧业在农业和农村经济中的作用
    要增加畜牧业基础设施建设的投入，加大对农民发展畜牧业的扶持力度，增强畜禽良种繁育、疫病防治和技术推广体系的服务功能，出台更直接、更有效、更有力的政策，加快全区畜禽良种的繁育推广，加大种质资源保护力度，提高畜牧业生产水平和畜产品质量，促进粮食生产与畜牧业的同步发展，进一步发挥畜牧业在促进农民增收致富中的作用。
    走养殖专业之路。畜牧养殖业正在全区蓬勃发展，农牧民也从发展养殖业中得到更多的好处。但值得注意的是，有些地方盲目跟风，没有根据本地实际来确定养奶牛还是养羊，是养鸡还是养猪，结果成效不显。这不仅没有给农牧民带来实惠，还挫伤了农牧民的积极性。各地在发展养殖业时，可借鉴畜牧业发达地区养殖业的经验，各乡村也应因地制宜地发展具有当地特色的养殖业，在养殖技术上多下功夫，形成养殖专业乡、专业村，真正让养殖业成为农牧民增收的重要途径。
    加快推进动物疫病防治体系建设，强化动物疫病防治工作
    继续加强重大动物疫病防治工作力度，强化产地检疫和畜禽流通的检疫监督，推进和深化兽医管理体制改革，加快动物疫病防治体系建设，提高动物卫生执法监管水平。建立健全自治区动物疫病防治的长效机制，为畜牧业健康发展提供有力保障。
    大力推进畜产品优势区域建设，提高畜产品竞争力
    农业部已经制定和实施了全国奶业肉牛肉羊优势区域发展规划，自治区也制定了相应的发展规划，对推动全区畜产品优势区域建设，提高畜产品市场竞争力都起到了积极的作用。今后要进一步加大对优势区域的扶持，围绕畜禽良种繁育、技术推广、疫病防治、草原?；ず退遣萘匣亟ㄉ璧戎氐慊方?，不断完善基础设施建设，健全支撑服务体系，提高优势产区产品竞争力，扩大出口，带动全区畜牧业生产的发展。
    采取有效措施，积极推动现代化畜禽养殖方式的转变
    要坚持以发展适度规模经营为主的生产方式，加快畜牧业规模化、集约化、专业化建设步伐，尽快做大做强畜牧业，推进畜牧业由数量增长型向质量效益型转变，着力提高畜牧业综合生产能力。要根据国家和自治区有关政策以及农业结构调整的需要，确保养殖小区的养殖用地。要多渠道筹集资金用于养殖小区和养殖场粪污处理设施的建设，积极推动现代化畜禽养殖方式的转变。
    提高畜牧业生产的组织化程度，推进畜禽健康养殖和产业化经营
    针对自治区畜禽养殖以农牧户分散为主体的实际情况，不断提高农牧户的组织化程度，密切产销关系。建立风险防范机制，提高防灾减灾能力。加大对畜产品加工龙头企业的扶持，以企牧利益联结机制为主的市场化服务体系建设，充分发挥龙头企业的带动作用，开展精深加工，提高附加值。围绕龙头企业建设生产基地，为农牧户提供培训，实行标准化生产，提高畜禽产品质量?；平】笛澈筒祷?，大力发展外向型畜牧业。
    加快畜牧业科技进步，继续推进畜牧业结构调整
    要适应市场需要，大力优化畜禽品种结构，加速畜禽品种改良，提高畜产品品质和市场竞争力。在继续稳定发展奶牛、优质肉羊肉牛、细毛羊等行业的同时，继续加快禽业、生猪和特色养殖业的发展。充分发挥自治区地方畜禽品种资源丰富的优势，加大开发利用的力度，培育新品种、新品系，满足市场对优质畜产品的需求。