大多数地区行动迟缓
    国务院于2005年5月份发布了《关于推进兽医管理体制改革的意见》，文件颁布了一年多了，据在报上宣传看到真正行动起来实行兽医体制改革的省、直辖市、自治区到目前为止不足三分之一，也即目前三分之二的省仍在那里观望、等待，迟迟没有行动。
    政府难当人事部门的家
    据说有的地区，省厅早已将兽医体制改革的方案做好了，省政府也早就转发了国务院的文件，但本省的方案就是没法出台和落实，原因是人事部门把握的尺度是撤一建一，不能增加机关和事业单位的编制，因为增加了编制就意味着增加财政经费。人事部门不同意，政府也没办法，唯一的办法就是先等等再说，看其他省区怎么办，我们再办也不迟。事情就这样年复一年地拖下来，这其中被拖垮的不仅是广大的农民养殖户，也拖垮了一省一市的地方经济发展。
    管理工作滞后
    作为全国畜牧兽医行政主管部门的农业部，面对大多数省区没有按国务院要求去落实兽医体制改革，应该说是心有余而力不足。因为农业部作为业务行政主管部门，没有和各省区政府签订军令状，只是眼睁睁地看着这种有身无腿的乡镇兽医站解体、基层队伍解散的局面一天天拖下去。其二，农业部和各省区政府在疫情防控上犯同样的错误，因为在农业部公布的国家法定动物疫病中仅把猪瘟、口蹄疫和猪水泡病列入一类动物疫病的病种，把猪链球菌病、猪蓝耳病列入二类动物疫病病种，至于猪传染性胸膜肺疫、猪圆环病毒病、猪流感、猪附红细胞体病等严重危害养猪业发展和人体健康的猪病连三类动物疫病都未能列入。而从农业部到省市县的各级政府一直是将一类动物疫病列为重大动物疫病的（如高致病性禽流感和口蹄疫）。由于这些病种未被列入重大动物疫病，因而各级政府对这些病的防控就没有摆到议事日程，就没有把其作为重点防控对象，更没有财政投入在这些病的防控上。因此，这就客观地造成农业部和省市县政府在大灾大难面前拿不出良策，也不能及时投入人力物力防控，致使疫情在南方诸省长达3个多月流行，目前仍得不到有效控制。这是给养猪业造成毁灭性损失的夏秋季节猪的高热病猖獗流行的又一重要原因。